业界对其功能争议很大
2020-11-18 12:32
来源:未知
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团队向顶级期刊投稿,审稿人却要求必须用clip(交叉互连免疫沉淀)技术明确rna的哪一个点和蛋白质相互作用,连接在一起。用语言很难解释蛋白质和rna在活体细胞内错综复杂的关联,姜明红给科技日报记者画图:一个长链rna会结合多个蛋白,这些蛋白有的是特异连接,连得紧密,有的就是“挂”在上面,而蛋白之外还会带上其他的rna,“缠绕”“连带”“虚实”……

clip技术和rip(rna结合蛋白免疫沉淀)技术类似,但是却能够达到单个碱基的分辨率。为此,通过海量实验,针对裂解液的成分如何影响细胞内物质,团队开始了如指掌;不同rna酶的脾气也熟练掌握。

clip很难做,国内实验室极少有成熟的经验。收到修改意见后的团队成员开始大量查阅论文。“国外的实验流程无法完全照搬,不同的细胞做法不同,需要重新摸条件。”团队中主要攻关这一技术的刘伦说。

在人类基因组中95%的基因并不编码蛋白质,其他物种也有大量的非编码基因。这些dna不会被编码成蛋白质,却又会转录出非编码rna,它们对生命活动起什么作用?是进化的冗余还是神秘的缓存?

“由于长链非编码rna(lncrna)丰度低,业界对其功能争议很大。”浙江大学生命科学研究院教授徐平龙在此前接受采访时评价道,但此次发表的研究严谨地鉴定了所发现的一种全新lncrna是有功能的,即能够进行免疫调控,而曹雪涛院士正是这一机制的主要开拓者之一。

“实验室的部分我们自己攻克了,但是测序公司表示无法进行匹配的测序工作,原因是无法合成特有的适当引物。”刘伦说,国内没有公司生产clip所需引物,而rna测序必须先反转录为cdna才能够进行,引物决定了反转录的准确性,决定了目标位点能否确定。实验室自己担负起rna转录、构建cdna文库的工作。完成3代测序、用化学方法测量分子间的相互作用力……这些免疫研究实验室原本并不擅长的难题被团队逐个攻克。

《细胞》杂志近日刊登中国工程院院士曹雪涛团队的研究论文,他们发现一种全新非编码rna分子。该分子能够调控免疫系统的“进”与“退”,这是此前学术界从未认识和证明的。

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